研究报告/Research Report

毛果杨LBD基因家族的全基因组分析  

芦强 , 邵芬娟 , 邱德有*
中国林业科学研究院林业研究所, 北京, 100091
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37 卷, 第 44 篇   
收稿日期: 2016年11月17日    接受日期: 2017年01月17日    发表日期: 2018年01月25日
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摘要

LBD (lateral organ boundaries domain)蛋白是一类植物所特有的转录因子,在调控植物生长发育、营养代谢以及逆境胁迫的响应等方面发挥重要作用。然而,在基因组水平上对毛果杨LBD基因家族的研究还未曾有过报道。本研究利用生物信息学方法,从毛果杨基因组中鉴定出57个LBD基因并预测其分子量和等电点,这些基因分布于毛果杨18条染色体和Scaffold_65、Scaffold_86上。该家族成员基因结构简单,内含子数目不超过2个。进化关系分析显示毛果杨LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。分析基因表达模式发现,该家族成员的表达具有一定时空特异性,并响应氮素胁迫处理。本研究为深入研究毛果杨LBD基因的功能奠定了基础。

关键词
毛果杨;LBD基因家族;系统进化分析;基因表达

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基因组学与应用生物学
• 第 37 卷
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