林春华¹ , 李兆龙² , 乔燕春¹ , 林伟君³ , 刘自珠¹ , 谭雪¹

1广州市农业科学研究院, 广州, 510308;
2仲恺农业工程学院生命科学学院, 广州, 510225;
3广东省农科院科技情报研究所, 广州, 510640
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 79 篇   
收稿日期: 2012年08月27日    接受日期: 2012年09月19日

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本实验对影响SRAP-PCR体系中的Mg2+、dNTPs和引物浓度等因子进行了体系优化，建立了一套适合白簕SRAP检测的25 μL反应体系：1.5 mmol/L Mg2+，1.5 mmol/L dNTPs，1 µmol/L引物，10 ng模板DNA，1.5 U Taq DNA聚合酶；进一步以白梗簕菜为模板，利用优化的体系进行多态性标记引物组合分析，共筛选出17对引物；利用这些引物对7个白簕品种进行SRAP遗传多样性分析，共扩增出461条谱带。其中多态性谱带155条，多态性谱带比率为33.6%，白簕品种间的相似系数为0.707 7~0.947 4。经UPGMA聚类分析结果显示，所检测的7个白簕品种分为两大类，其中亲缘关系较近的青梗簕菜和细叶密刺簕菜聚成了一组；而其余的4个种，包括白梗簕菜、细叶小刺簕菜、紫柄簕菜、大叶大刺簕菜和红梗簕菜，聚成另一组。

白簕；SRAP反应体系；优化；系统分析