基于cpDNA atpB-rbcL非编码序列分析桫椤种群遗传结构和遗传多样性,以贵州赤水桫椤国家级自然保护区为例  

杨明照1,2 , 应站明3 , 喻君生4
1 广州卫生学校; 2 广州医学院卫生职业技术学院, 广州, 510450; 3 萍乡高等专科学校, 萍乡337000; 4喻君生, 中山大学, 广州 510275
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 30 篇   
收稿日期: 2012年12月15日    接受日期: 2013年01月09日
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摘 要

以PCR产物克隆后测序的方法测定了贵州赤水桫椤国家级自然保护区三个种群59个个体的叶绿体DNA(CpDNA) atpB-rbcL非编码区序列。序列长度介于727~732bp之间,具长度多态性,A+T百分比含量较高,介于63.27%~63.89%之间。遗传多样性水平较低,表现出较高的单倍型多样性(h=0.639)和低的核苷酸多样性(Dij=0.00028)并存的特征,提示现有种群可能源自一个有效群体规模较小的种群的快速扩张,扩张时间尚短,不足以形成更为复杂的遗传结构。种群间的高基因流Nm,低遗传分化度FST,AMOVA分析以及DNA歧异度结果一致显示各种群间无明显的遗传分化。

关键词
桫椤;叶绿体DNA atpB-rbcL非编码序列;遗传结构;遗传多样性
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基因组学与应用生物学
• 第 32 卷
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