金纹细蛾几丁质酶基因生物信息学分析  

范晓军 , 宋志芳 , 仙笑笑 , 李 瑶 , 赵秋勇
太原理工大学化学化工学院生物与制药工程系,太原,030024
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2012年09月12日    接受日期: 2012年10月19日
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摘 要

本文从生物信息学角度对克隆获得的金纹细蛾几丁质酶进行分析,通过课题组提交到GenBank的数据,采用在线分析及相应软件分析预测金纹细蛾几丁质酶(LrCHI)基因核苷酸和氨基酸序列的组成、理化性质、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、疏水性、二级结构和三级结构等,并构建系统发育树。结果表明:LrCHI开放阅读框由1737 bp组成,推导578个氨基酸;此序列所编码的蛋白属于几丁质酶18 家族,其N端含有信号肽和几丁质酶18家族活性位点,C端为几丁质结合区,无跨膜结构域区域;预测LrCHI为亲水性蛋白;金纹细蛾与鳞翅目的棉铃虫、甜菜夜蛾进化关系最近。分析结果可为LrCHI的科学研究提供有价值的信息,为进一步研究其高级结构与功能的关系提供理论依据。

关键词
金纹细蛾;几丁质酶;生物信息学分析;理化性质;系统发育树
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基因组学与应用生物学
• 第 32 卷
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