方家林 , 龙青姨 , 华玉伟 , 黄华孙

1 中国热带农业科学院橡胶研究所, 农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室, 儋州, 571737
2 云南省热带作物科学研究所, 景洪, 666100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2013 年, 第 32卷, 第 92 篇   
收稿日期: 2013年05月24日    接受日期: 2013年06月14日

群体结构是引起关联分析假阳性的最主要因素。本研究基于25个EST-SSRs位点，以283份橡胶树栽培品种为群体，分析了群体中25个EST-SSRs位点哈迪-温伯格平衡和群体分层，结果显示在被检查25个位点中13个位点偏离哈迪-温伯格平衡；在共组系数为50%、60%、70%、80%时，283份种质中具有明确亚群归属的分别只有155份、110份、61份和22份，占总种质的54.78%、38.87%、21.55%和7.78%；同时，25个多态位点共形成了300个位点组合中20个位点组合(6.67%)呈显著的连锁不平衡状态，其中5个组合(1.67%)达到极显著连锁不平衡。故283份橡胶树栽培品种所构成的群体具有一定的群体分层，但分化程度较小，可用于关联分析。

橡胶树；魏克汉种质； EST-SSRs； 群体结构；关联分析