尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种中Fsr1基因的克隆及生物信息学分析  

毛超1,2 , 戴青冬1,2 , 杨腊英2 , 汪 军1 , 黄俊生2
1 海南大学农学院,海口,570228
2 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所,海口,571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2013年07月24日    接受日期: 2013年08月21日
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摘 要

以尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种为材料,克隆其Fsr1基因的DNAcDNA全长,并对其进行生物信息学分析。根据镰刀菌中相关基因设计简并引物,结合PCR RT-PCR 技术扩增目的片段,进行氨基酸序列推导后分析。得到结果FoFsr1基因开放阅读框为2474bp,共编码824个氨基酸;FoFsr1基因编码蛋白可能是存在于细胞核中的跨膜亲水蛋白,含有54个蛋白磷酸化位点,不含有信号肽;该蛋白主要含有1Striatin 结构域及7WD40结构域,二级结构主要由β折叠和无规则卷曲组成,其中不含有亮氨酸拉链结构;同源性分析发现其与丛赤壳菌属中的Fsr1 蛋白亲缘关系最近。通过结构分析发现,推测该蛋白可能在细胞周期及细胞凋亡过程中起信号转导与转录调控的作用,从而对病原菌的致病力产生影响。

关键词
FOC4;Fsr1;生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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