张元燕^1,2 , 方炎明¹

1 森林资源与环境学院, 南京林业大学, 南京, 210037
2 风景园林与建筑学院, 浙江农林大学, 杭州, 311300
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 6 篇   
收稿日期: 2013年04月24日    接受日期: 2013年06月18日

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为开发栎属遗传多样性检测的SSR标记，分析了蒙古栎、无梗花栎、夏栎、欧洲栓皮栎EST-SSR的特点，结果表明蒙古栎的EST中3209.46bp有一个SSR、无梗花栎中每6160.36bp有一个SSR、夏栎中每5883.30bp有一个SSR、欧洲栓皮栎中每6129.12bp有一个SSR。蒙古栎、无梗花栎、夏栎、欧洲栓皮栎EST-SSR的平均长度分别为21.65b、 21.1bp、20.66bp和20.65bp。四种栎类中不同基元的EST-SSR的分布频率具有非常一致的特征，均是二基元、三基元和六基元的SSR分布频率最高，达20%以上。而四基元和五基元的SSR在四个种类中的分布不到0.05%。二基元的SSR中大于1%的SSR均是AG、CT、TC、GA、AT、TA基元，并且在蒙古栎、无梗花栎和夏栎中AG、CT、TC基元的分布频率最高，而在欧洲栓皮栎中是TC、GA、AG的分布频率最高；三基元的SSR中，含CAA、GAA、TCT、CTT的SSR在四种栎类中都存在。六基元 的SSR中大于1%在四种栎类中出现的类型均较少，为0~4种。

蒙古栎；无梗花栎；夏栎；欧洲栓皮栎；EST-SSR