基于cvtree方法和复杂网络理论的癌症进化树分析  

沈路明 , 韦芳萍
广西大学物理科学与工程技术学院, 南宁, 530004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 39 篇   
收稿日期: 2014年01月06日    接受日期: 2014年02月11日
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摘 要

进化树是一种能够形象直观地反映出生物进化关系的树型结构图。本文从癌症的核酸序列出发,将cvtree方法与复杂网络理论相结合,构建了亲缘关系进化网络,并根据所得网络参数构建进化树。通过分析进化树图形,给出了相关癌症的进化关系,为今后对癌症的进一步研究提供了新的视角。研究结果表明,某些种类的癌症跟其它种类的进化关系较近,而某些种类的癌症则跟其它的进化关系较远;同时,在cvtree方法中取不同的串长值和不同的亲缘距离下,得到的进化树,所反映的进化趋势呈现出一定的规律。

关键词
进化树;cvtree方法;复杂网络;癌症
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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