崔振

山东理工大学生命科学学院, 淄博, 255000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 57 篇   
收稿日期: 2013年11月12日    接受日期: 2013年12月26日

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高通量测序技术在DNA测序发展历程中具有里程碑的意义。本文首先介绍了高通量测序及其主要应用。高通量测序应用广泛，产生的数据具有数据量大，序列短等特点。单纯通过改进算法已经不能满足用户对数据处理速度的要求。高性能并行计算服务器通常用来进行高通量测序数据分析，然而这些服务器价格昂贵，维护成本高，对有些研究机构来说并不是最好的选择。而云计算具有低成本、高自动性、高灵活性等特点，可作为高通量数据分析的一种解决方案。用户在进行数据分析时，选择相应的程序部署到云平台上。该类程序通常需要实现MapReduce计算模型。随后本文介绍了几款利用云平台进行高通量分析的应用程序，包括它们的主要功能，采用的算法思想，优缺点。为选择和使用和该类软件提供指导。

云计算； 高通量测序； MapReduce