PEG胁迫下玉米基因表达谱分析  

李培培 , 王接弟 , 孔广超
石河子大学农学院/ 新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室, 石河子, 832003
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 59 篇   
收稿日期: 2014年01月27日    接受日期: 2014年03月05日
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摘 要

为了解PEG胁迫下玉米基因表达情况,本研究采用数字化基因表达谱(DEG)技术,检测了20% PEG胁迫下玉米植株中基因表达谱,同时利用实时荧光定量PCR技术对部分基因表达特点进行了验证。结果表明玉米植株在20%PEG胁迫下48h时,共检测到有31829个基因的表达发生了改变,其中表达量差异达到1倍以上的基因共1438个,其中801个表达量呈现上调,637个表达量呈现下调。这些差异表达基因的功能主要涉及到结合、催化、转录、抗氧化剂活性,参与代谢过程、细胞过程、定位、生物调节、定位建立以及刺激反应等。实时荧光定量分析表明7个随机选择的基因在胁迫前后的表达特点与表达谱测序结果一致。本研究所建立的玉米植株基因表达谱为比较全面的获得玉米与耐旱应答相关的候选基因以及揭示与耐旱性相关的基因表达特点奠定了基础。

关键词
玉米; 基因表达谱; RNA-Seq; PEG;胁迫
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基因组学与应用生物学
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