牛DLK1基因的生物信息学分析  

苏红1 , 蒙淑翠1 , 李冬杰2 , 李世杰3
1 中国地质大学长城学院,河北保定,071001;2 河北科技大学生物科学与工程学院,河北石家庄,050018;3 河北农业大学生命科学学院,河北保定 071001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2014年12月03日    接受日期: 2015年01月01日
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摘 要

DLK1 基因是位于DLK1-DIO3印记区域内一个父源表达的印记基因。本研究利用生物信息学方法对牛DLK1基因进行了分子进化分析、基因和蛋白质结构分析并预测了其启动子和CpG岛区域。对7种动物DLK1 基因mRNA序列的分子进化分析结果显示,牛与羊的遗传距离最小,亲缘关系最近。蛋白质在线分析软件表明,DLK1蛋白由信号肽、EGF结构域以及跨膜区组成。牛DLK1基因包含5个外显子,且存在多种可变剪切体。启动子在线软件预测,牛DLK1核心启动子可能位于该基因起始密码子上游1790-1840 bp处。预测结果表明,人、小鼠和牛三个物种DLK1潜在的核心启动子区所处的位置具有一致性,并且三个物种的启动子区DNA序列具有高度保守性。以上研究结果为进一步阐明牛DLK1基因的生物学功能及其印记调控机理提供了参考依据。

关键词
牛;DLK1基因;生物信息学
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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