甘蔗KNOX基因(Sckn1)的电子克隆及生物信息学分析  

李旭娟 , 刘洪博 , 林秀琴 , 吴转娣 , 徐超华 , 刘新龙
云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室, 开远, 661699
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 21 篇   
收稿日期: 2014年12月03日    接受日期: 2015年01月01日
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摘 要

KNOX基因对植物顶端分生组织的形成和维持有至关重要的作用。本文选择功能已知的水稻KNOX基因(OSH1, Oskn1 )为参考序列,采用电子克隆技术克隆到甘蔗中与OSH1同源的一个KNOX基因Sckn1,并通过生物信息学分析预测该基因的结构、功能。结果表明:该基因包含一个1071bp的开放阅读框,编码356个氨基酸,分子量为39.36KD,理论等电点为6.47。该基因很可能定位于细胞核,起转录调控作用,序列比对发现该基因编码蛋白与高粱、玉米、小米草等KN1蛋白高度相似。以上分析结果为进一步研究Sckn1基因的功能奠定了坚实的基础。

关键词
甘蔗;KNOX基因;电子克隆;生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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