孙兰茜 , 常平安 , 曾鑫 , 韩丽萍 , 冉凤 , 王超颖 , 王玲 , 黄飞飞

重庆邮电大学生物信息学院, 重庆, 400065
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2014年12月03日    接受日期: 2015年01月01日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

甘油磷酸二酯酶(glycerophosphodiesterrase, GDE)是原核和真核生物中高度保守的一类酶，然而不同物种存在不同数量的蛋白成员。本文以8种模式生物的甘油磷酸二酯酶家族蛋白为基础，通过邻接法构建该家族的进化树，以了解GDE家族成员的进化关系。采用多序列比对、RNA剪接位点(外显子/内含子)分析以及跨膜结构域预测对所建树进行信息挖掘。通过上述方法，提出并初步验证了GDE家族分为3个亚族的观点，即第一亚族为GDE5，第二亚族包括GDE4和GDE7，第三亚族含有GDE1、GDE2、GDE3、GDE6四个成员。

甘油磷酸二酯酶；分子进化；序列比对；RNA剪接位点；跨膜结构域