高娃^1,2 , 姜威^1,2 , 孟利强^1,2 , 李晶^1,2 , 陈靖宇¹ , 曹旭^1,2 , 胡基华¹ , 刘宇帅^1,2 , 张鹏远³ , 张淑梅^1,2

1黑龙江省科学院微生物研究所, 哈尔滨, 150010; 2黑龙江省科学院高技术研究院, 哈尔滨, 150020; 3东北农业大学资环学院, 哈尔滨, 150030
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基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 51 篇   
收稿日期: 2015年01月01日    接受日期: 2015年01月30日

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本研究以解淀粉芽孢杆菌TF28为材料，采用PCR 方法从基因组DNA中扩增出抗菌蛋白TasA基因，利用生物信息学方法对TasA基因序列及其编码的蛋白质结构进行分析和预测。结果表明TasA基因全长786bp，含有一个完整的开放阅读框和一个终止密码子，编码261个氨基酸，经Blast比对，该基因与其它解淀粉芽孢杆菌TasA基因同源性为95%-99%，与B. amyloliquefaciens FZB42 (CP 000560.1) TasA基因序列同源性最高为99%，与B. amyloliquefaciens DSM7（FN597644.1）的同源性最低为95%。预测该基因编码蛋白质分子量为28 kD，等电点为6.35，是含有信号肽和跨膜结构的亲水蛋白，蛋白结构中含有糖基化和磷酸化位点，二级结构中以α螺旋、β折叠和无规则卷曲为主。

解淀粉芽孢杆菌；TasA基因；序列分析；蛋白结构预测