不同兔种遗传多样性与聚类分析  

郝荣超1 , 刘芳2 , 王国华1 , 杨国忠1
1河北北方学院, 动物科技学院, 张家口, 075000; 2 河北北方学院, 生命科学研究中心, 张家口, 075000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 110 篇   
收稿日期: 2015年02月06日    接受日期: 2015年02月27日
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摘 要

从NCBI数据库中下载来自不同国家的20个兔种135条序列,进行遗传多样性与亲缘关系分析。结果显示来自美国的白尾兔遗传多样性最高,核苷酸多样性为0.29270±0.10157,单倍型多样性为0.964±0.077;来自墨西哥的黄喉兔核苷酸多样性最低,为0.00255±0.00080。中国兔种中,云南兔遗传多样性较低,核苷酸多样性与单倍型多样性分别为0.02170±0.00876,0.600±0.54;白尾兔种内及种间遗传距离较远,而黄喉兔与白尾兔之外的任何一个兔种遗传距离都较远,但种内遗传距离为0.000;从聚类图分析,草兔在大多数兔种群体中均有聚类,且都分布在A支系。说明黄喉兔遗传多样性贫乏,处于濒临灭绝的边缘;草兔地理分布范围广且数量众多;云南兔遗传多样性较低。

关键词
兔;遗传多样性;亲缘关系
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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