丹参香豆酸-3-羟化酶基因(SmC3H)的生物信息学及其组织表达模式分析  

王斌 , 韩立敏 , 化文平 , 陈尘
药用资源与天然药物化学教育部重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西师范大学, 生命科学学院, 西安, 710062
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 127 篇   
收稿日期: 2015年02月02日    接受日期: 2015年02月27日
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摘 要

通过分析丹参转录组数据库(SRX021907)得到一条香豆酸-3-羟化酶(C3H)基因,blast比对发现该基因为丹参C3H (EU358957.1),该基因cDNA全长1704 bp,包括1个1 503 bp的开放阅读框,编码508个氨基酸。生物信息学分析表明,其编码蛋白的分子量为57.21kDa,等电点为8.53,含α-螺旋,延伸链和无规则卷曲,具有1个细胞色素P450蛋白(CYP450)特异的保守结构域。聚类分析表明其与芝麻的亲缘关系最近。组织特异性表达分析结果表明,该基因在茎中的表达量最丰富,其次是叶和花,根中最低。

关键词
丹参;香豆酸-3-羟化酶;生物信息学;组织表达模式
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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