抗PRRSV双功能单链抗体基因的构建、序列分析及蛋白结构预测  

刘金凤1 , 吴健敏1 , 杜毅超1,2 , 覃绍敏1 , 林俊1 , 马玲1 , 白安斌1 , 陈凤莲1 , 饶桂波1
1广西兽医研究所, 广西畜禽疫苗新技术重点实验室, 南宁, 530001; 2广西大学动物科学技术学院, 南宁, 530001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 154 篇   
收稿日期: 2015年03月02日    接受日期: 2015年03月31日
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摘 要

为构建抗PRRSV与抗人红细胞单链抗体(2E8-ScFv)融合的双功能单链抗体基因并预测其结构和功能。以PRRSV杂交瘤细胞株为模板,通过RT-PCR和SOE-PCR构建PRRSV-ScFv基因,将其重组到2E8-ScFv C端构建双功能单链抗体基因并测序分析,利用生物信息学软件预测其结构功能。结果显示,成功获得长735bp的PRRSV-ScFv基因,由Linker、VH和VL组成,VH、VL均含明确的CDR和FR区及特征性Cys,与多种鼠源ScFv基因高度同源,具有重组功能性鼠源抗体可变区特征,与2E8融合后形成全长1470bp的2E8-PRRSV-ScFv基因。经生物信息学分析,融合基因编码490个氨基酸,为亲水性蛋白;结构预测分析显示,其存在丰富的二级结构,可折叠形成含有多个沟槽结构的空间构象,利于抗原的结合,理论上具有良好的抗原结合活性。本研究成功构建抗PRRSV双功能单链抗体基因并对其编码的蛋白质结构进行了预测,为今后进行融合蛋白的表达及最终研究PRRSV抗原快速检测方法奠定基础。

关键词
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV);双功能单链抗体;序列分析;蛋白结构预测
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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