鸡GDF5基因遗传多样性及生物信息学分析  

郭发荣1,2 , 陈彬1,2 , 李太山1,2 , 张小卿2 , 綦世金1,2
1贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵州大学动物科学学院, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵阳, 550025; 2贵州大学, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 148 篇   
收稿日期: 2015年03月02日    接受日期: 2015年03月31日
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摘 要

为分析鸡GDF5基因的遗传多样性及结构与功能,本试验采用DNA池结合PCR产物直接测序法和生物信息学对9个鸡品种11种样品GDF5基因进行研究。试验共检测出10个SNPs,且全为同义突变,突变后RNA二级结构发生变化,自由能变小,稳定性随之增强;GDF5蛋白存在信号肽,成熟肽始于第19位氨基酸;同源模建预测得到的蛋白结构模型理想可靠。结果表明GDF5基因具有丰富的多态性,生物信息学结果可为进一步研究GDF5基因的作用机制和GDF5蛋白功能提供理论基础。

关键词
GDF5基因;遗传多样性;生物信息学;鸡
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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