陈毓¹ , 张卫柱² , 刘玲玲¹ , 杨玉娥¹ , 杨章民¹

1陕西师范大学生命科学学院, 西安, 710119; 2 西安回天血液制品有限责任公司, 西安, 7100751
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 175 篇   
收稿日期: 2015年04月01日    接受日期: 2015年04月30日

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C-型凝集素样蛋白是一类钙离子依赖型的具有糖结合活性的非酶蛋白，可结合凝血因子及血小板而影响人体的凝血系统稳态，具有抗凝作用。本研究基于中介蝮（Gloydius intermedius）蛇毒C-型凝集素样蛋白α 链和β 链的部分核苷酸序列，设计了2对PCR引物，通过RT-PCR技术从中介蝮毒腺中克隆出的α和β链(Gi-CLP α、Gi-CLP β)的全长cDNA，克隆入T载体后，对所获克隆进行了测序，并进行了生物信息学分析。结果表明，Gi-CLP α、Gi-CLP β的开放阅读框(ORF)分别为477bp和462bp，分别编码158和153个氨基酸，信号肽分别为21个和23个氨基酸。蛋白质一级结构同源性分析表明，Gi-CLP α和Gi-CLP β之间的序列相似度为29%，Gi-CLP α和β分别与日本蝮(Gloydius blomhoffi)的Mamushigin α亚基和β亚基的同源性最高（90%和93%），Gi-CLPα和Mamushigin的α亚基氨基酸序列的差异主要有13个，Gi-CLP β和Mamushigin的β亚基氨基酸序列的差异主要有7个。用蛋白功能预测软件SIFT在线分析表明，Gi-CLP α中第47和136位的氨基酸差异使得Gi-CLP α与Mamushigin α的功能明显不同，而Gi-CLP β和Mamushigin β亚基的功能没有明显差异。由于Gi-CLP α和β链会像Mamushigin那样通过二硫键形成异二聚体，这些一级结构的差异会影响其与靶蛋白的结合特性，这一结果为下一步研究Gi-CLP的功能及利用奠定了理论基础。

中介蝮；蛇毒C-型凝集素样蛋白；cDNA, 克隆；生物信息学