木薯可溶性淀粉合成酶(MeSSⅡb)启动子克隆及梯度缺失分析  

关志辉1,2 , 陈新2 , 王海燕2 , 刘陈1,2 , 马平安1,2 , 胡梅珍1,2 , 王文泉2
1海南大学农学院, 海口, 570228; 2 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口, 571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 271 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

木薯淀粉被广泛用作各种食品、饲料及工业淀粉制品的原材料。然而目前,国内外还未见木薯可溶性淀粉合成酶基因MeSSs的启动子相关研究报道。本研究通过,在木薯基因组数据库中查询MeSSⅡb基因第一个外显子及其上游序列,通过PCR扩增获得MeSSⅡb上游序列。对获得的上游序列通过PlantCARE及PLACE进行启动子结构及元件分析,并与其他物种中SSSs基因启动子区序列利用BLAST进行比对分析后,确立翻译起始位点上游1566bp序列为启动子区,进而设计并构建了包括完整启动子在内的5’端梯度缺失启动子融合GUS蛋白植物表达载体pE1566::GUS、pE1356::GUS、pE1116::GUS、pE531::GUS、pE453::GUS、pE387::GUS、pE138::GUS转化本氏烟草进行启动子活性验证。利用叶盘侵染法转化本氏烟草进行启动子梯度缺失分析后发现,缺失启动子pE1356、pE1116、pE531活性丧失,缺失至翻译起始位点上游138bp的缺失启动子pE138,仍具有启动子活性。上述表明,在克隆启动子区1566bp片段中,在-1566和-1356bp之间210bp序列片段对于完整启动子活性尤为重要,而-1356至-531bp之间存在启动抑制因子,在-453和-138bp为基础启动序列,初步推断为转录起始结合位点。

关键词
木薯;可溶性淀粉合成酶Ⅱ;启动子;核心启动子区;缺失分析
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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