马氏珠母贝组蛋白H3基因的克隆与表达特性分析  

潘晓艳 , 郑哲 , 田荣荣 , 焦钰 , 杜晓东
广东海洋大学水产学院, 湛江, 524025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 220 篇   
收稿日期: 2015年06月01日    接受日期: 2015年06月30日
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摘 要

组蛋白H3是组成核小体的基本组分之一。研究表明,组蛋白不仅参与染色质的组装,也可以通过调节基因表达参与调控细胞分裂、凋亡、DNA修复等细胞生命过程。为了探究马氏珠母贝组蛋白H3 (Pinctada martensii histone H3, PmH3)的序列及表达特征,本文运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆得到PmH3的cDNA全长序列,并且应用实时荧光定量PCR技术对PmH3基因在马氏珠母贝不同组织中的表达进行检测。结果显示,PmH3基因序列全长627 bp,其中开放阅读框(ORF)为411 bp,编码136个氨基酸,5' UTR为42 bp,3' UTR为174 bp,包含26 bp的polyA。预测其相对分子量为15 388.0 Da,理论等电点为11.27,不稳定系数为47.19,疏水性水平-0.604。多序列比对结果表明H3基因极为保守,在各物种间的相似度达到99%~100%。SMART软件分析发现PmH3具有一个典型的H3结构域。荧光定量PCR数据结果显示,PmH3基因在马氏珠母贝外套膜边缘区、外套膜中央区、鳃、血细胞、闭壳肌、足、性腺、肝胰腺八种组织中均有表达,其中在性腺中表达量最高。本研究可为进一步探讨PmH3基因在贝类中的生物学特性以及组蛋白修饰提供理论依据。

关键词
马氏珠母贝;组蛋白H3;基因克隆;荧光定量PCR;组蛋白修饰
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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