辣椒查尔酮合成酶基因家族全基因组鉴定及表达特征分析  

徐婉莉 , 裴徐梨 , 荆赞革 , 熊自立
浙南作物育种重点实验室, 温州科技职业学院, 温州, 325006
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 270 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

查尔酮合成酶(chalcone synthase,CHS)是植物色素合成的一个关键酶,对植物的生长发育具有重要作用。本试验依据辣椒的基因组数据,采用生物信息学的方法对辣椒CHS基因家族进行鉴定及分析。结果得出该基因家族含有7个成员,氨基酸序列长度介于213aa-402aa之间,基因间序列相似性变化幅度较大,具有高度遗传多样性。基因特性分析发现7个基因含有高度保守的结构域,内含子数较少,为1-2个,它们主要分布于3条染色体上,其中以12号染色体分布最多;此外通过系统进化分析可将CHS基因分为两大类。对辣椒CHS基因的组织表达及果实发育的9个不同时期的表达进行分析,结果表明CHS家族基因具有组织表达特异性和发育时期表达特异性,每个成员具有不同的调控方式。本研究不仅为今后了解辣椒CHS基因家族的功能和进化奠定基础,同时为遗传性状改良提供候选资源。

关键词
辣椒;查尔酮合成酶;基因家族鉴定;生物信息学;表达分析
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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