任丽群^1,2 , 燕志宏^1,2 , 顾丽菊^1,2 , 李平^1,2 , 林鹏飞^1,2 , 王明³

1贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 2高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025；3贵州省农业委员会，贵阳，550025
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基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 368 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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以贵州宗地花猪和贵州从江香猪2个地方猪种为研究对象，构建基因组DNA池，扩增GDF9基因第1外显子和第2外显子序列，采用直接测序法对2个品种的GDF9基因进行单核苷酸多态性进行检测，利用生物信息学软件预测不同多态性位点对GDF9基因mRNA二级结构、蛋白质二级结构的影响。结果表明，在2个品种中共检测到T⁹⁹⁷A、C¹⁰⁰⁹T、T¹⁰¹⁴C、G¹¹³⁷T和A¹¹⁹⁶T 5个SNPs位点，其全位于第二外显子上。T⁹⁹⁷A、C¹⁰⁰⁹T和A¹¹⁹⁶T均为错义突变。T⁹⁹⁷A导致编码的苯丙氨酸(Phe)变为异亮氨酸(Ile)、C¹⁰⁰⁹T导致编码的亮氨酸(Leu)变为苯丙氨酸(Phe)、A¹¹⁹⁶T导致编码的赖氨酸(Lys)变为甲硫氨酸(Met)。SNPs位点对于GDF9基因的mRNA二级结构、蛋白质二级结构有一定影响。

宗地花猪；从江香猪；GDF9基因；SNPs；生物信息学