白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析  

马成通1,2 , 钱洁颖1,2 , 刘镛3 , 陶晨陈1,2 , 苏荷玲2,4 , 晁耐霞1,2 , 吴耀生1,2
1广西医科大学生物化学与分子生物学教研室, 南宁, 530021; 2广西高校生物分子医学研究重点实验室, 南宁, 530021; 3广东医学院药学院, 东莞, 523808; 4桂林医学院, 桂林, 541004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 19 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase,SS)基因cDNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端,两者拼接得到全长cDNA序列。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1CsSS2,其cDNA序列全长分别为1627bp和1534bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 kD。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,为后续葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析建立基础。

关键词
白皮黄瓜;鲨烯合酶;RACE;基因克隆;生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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