枯草芽胞杆菌BSD-2中ybfB基因敲除及生物信息学分析  

安丽康1,2 , 胡彦婷1,3 , 王雅娜1,2 , 刘洪伟1 , 尹淑丽1 , 程辉彩1 , 张根伟1 , 张丽萍1
1河北省科学院生物研究所, 石家庄, 050081; 2河北师范大学, 石家庄, 050000, 3河北工业大学, 天津, 300000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 418 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

在前期突变体库研究中发现,ybfB缺失的枯草芽胞杆菌Bacillus subtilis BSD-2丧失了其抑真菌活性。本研究通过敲除并恢复ybfB基因,进一步确认其缺失对菌株BSD-2生物活性的影响,并利用生物信息学手段对其序列进行了预测分析。本研究成功敲除BSD-2菌株的ybfB基因,构建突变株B-Y-k,并成功构建其回复突变株B-Y,平板对峙实验结果显示突变其ybfB基因该菌株失去其抗真菌活性,回复突变株抗真菌活性恢复,表明该基因与其抗真菌相关。生物信息学分析显示该基因全长1251bp,编码416个氨基酸,具有12个跨膜螺旋区,为疏水性蛋白,推测该蛋白为疏水性跨膜转运蛋白,可能参与活性物质的转运。这些工作为下一步研究提供了一定基础。

关键词
枯草芽胞杆菌BSD-2;YbfB基因;同源双交换重组;蛋白结构预测
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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