致倦库蚊Cecropin基因家族的比较和系统发育分析  

赵文静 , 张晶 , 张春林 , 翟素珍 , 王吉平
贵州医科大学基础医学院生物学教研室, 贵阳, 550004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 46 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

利用生物信息学方法比较分析了致倦库蚊Cecropin家族4成员的基因结构、氨基酸序列、蛋白理化特性,预测蛋白空间结构,并基于7种昆虫绘制分子进化树,随后使用RT-PCR方法获取致倦库蚊Cecropin家族4成员的cDNA。结果表明:致倦库蚊Cecropin家族基因有两条正向编码,两条反向编码,长度为330~544 bp,由2个外显子和1个内含子构成;氨基酸序列长度为59~61 aa,具有两条基序和多个保守位点;编码的蛋白理论分子量为6 284.6~6 619.0,pI值为10.36~11.24,亲水性平均系数为0.393~0.551; 蛋白预测的二级结构和三级结构结果基本一致, 它们具有1个信号肽结构域和1个催化结构域,结构域主要由α-螺旋构成;7种昆虫的Cecropin蛋白进化关系与物种进化关系基本一致,并以“目”或“亚目”为单位分别聚类,CPIJ005108与致倦库蚊Cecropin祖先基因最相似。本研究的分析结果可为整个蚊科的Cecropin结构和功能的研究提供有价值的信息。

关键词
致倦库蚊;Cecropin;基因家族;生物信息学
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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