胡亚强 , 丁敬敬 , 黄勃 , 李溪宁

海南大学海洋学院, 海口, 570228
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 62 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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为了解团水虱不同生长阶段的肠道微生物多样性，采用MiSeq高通量测序技术和生物信息学分析手段，构建团水虱幼体、稚体、成体三个生长阶段肠道微生物的16S rRNA基因测序文库，分析三个样品中的菌群组成和生物多样性。结果表明，成体(T1)、稚体(T2)、幼体(T3)三个生长阶段肠道微生物样品共产生794个OTU，分别含646，686，156个OTU。分析显示，共检测到25个细菌门类，其中包括变形菌门、拟杆菌门、梭杆菌门等3个优势菌门。变形菌门为三个样品的共同优势菌，在幼体、稚体和成体中分别占51.7%，55.1% 和51.6%；拟杆菌门为稚体(30.21%)和成体(38.57%)的次优势菌门，在幼体肠道内低于5%；梭杆菌门在幼体体内占37.8%，是幼体的次优势菌门，但在稚体和成体体内均低于2%。幼体与其他两个生长阶段的肠道细菌群落结构差异显著，与稚体和成体的共有OTU数量，占检测到的OTU总数的比例均低于25%。其中稚体肠道细菌有着最高丰富度及多样性，其Chao指数为697.15、Shannon指数为4.69，及最低的Simpson优势度指数为0.035 1，而幼体肠道细菌丰富度和多样性最低。研究结果表明，团水虱肠道菌群种类丰富，幼体肠道菌群种类及其多样性与稚体、成体差异明显；菌群变化与各生长阶段团水虱生活习性关系密切。

团水虱；肠道微生物；16S rRNA；MiSeq高通量测序