四膜虫功能基因组数据库增量更新2016-生活史和减数分裂转录组及磷酸化蛋白组资源建设  

杨文涛1,2 , 张晶1,2 , 闫冠雄1,2 , 田苗1,2 , 袁冬霞1 , 缪炜1 , 曾宏辉1 , 熊杰1
1中国科学院水生生物研究所水生生物多样性与保护重点实验室, 武汉, 430072; 2中国科学院大学, 北京, 100049
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 189 篇   
收稿日期: 2016年02月02日    接受日期: 2016年03月07日
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摘 要

原生动物嗜热四膜虫是一种优良单细胞真核模式生物,以其作为研究对象在基础生物学领域的研究已经取得了一系列突破性的成果。2006年,其大核基因组测序完成并发表,标志着四膜虫的研究进入了功能基因组时代。2013年,基于基因芯片、基因网络和转录组数据,我们构建了四膜虫功能基因组数据库,其目前已成为模式生物嗜热四膜虫研究的两个重要数据库之一。在过去几年里,随着对四膜虫功能基因组学研究的深入,相关组学数据也实现了一定积累,对这些数据的整合也非常迫切。基于此,我们对四膜虫功能基因组数据库进行了增量更新。更新内容主要包括三个方面:1)四膜虫生活史不同时期转录组数据;2)四膜虫接合生殖减数分裂过程转录组数据;3)磷酸化蛋白组数据。此次增量更新进一步提升和完善了四膜虫功能基因组数据库的内容和功能,对以四膜虫为对象的相关研究工作具有重要作用。

关键词
四膜虫;四膜虫功能基因组数据库;增量更新;生活史转录组;减数分裂转录组;磷酸化蛋白组
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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