致倦库蚊几丁质酶家族基因的鉴定与分析  

赵文静1 , 张晶1 , 张春林1 , 王吉平1 , 孙谦2
1贵州医科大学基础医学院生物学教研室, 贵阳, 550004; 2国家知识产权局专利局专利审查协作北京中心, 北京, 100081
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 125 篇   
收稿日期: 2015年12月28日    接受日期: 2016年02月02日
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摘 要

利用生物信息学方法鉴定致倦库蚊23条几丁质酶基因,并对它们进行命名、分组,以及基因结构、蛋白结构域、蛋白理化特性和系统发育分析,随后使用qPCR方法检测CqCht10在致倦库蚊生长各时期的相对表达量。结果表明,致倦库蚊几丁质酶基因长度为   1360~19 218bp,蛋白长度为353~2 681aa,分子量为39.557~279.503kDa,等电点为4.76~8.69。它们属于GH18家族,每条几丁质酶包含信号肽区域、催化结构域、几丁质结合域和连接区域,但包含的数量不同。此外,每条几丁质酶的催化结构域均包含保守序列FDGXDLDWEYP。本研究将致倦库蚊几丁质酶划分为12组,组I~组VII沿用早期研究的分组标准,此外将组VIII更名为组IX,再新增4个分组。CqCht10的qPCR实验结果显示,该基因在II龄~IV龄幼虫期呈高表达,在蛹期和成虫期呈低表达,而在卵期和I龄幼虫期呈低表达,而在其他时期呈微量表达,提示该基因与致倦库蚊的蜕皮相关。本研究的分析结果能够为致倦库蚊几丁质酶基因的功能研究提供有价值的信息。

关键词
致倦库蚊;几丁质酶;CH18家族;生物信息学
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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