海南仙人掌matK基因的克隆和序列分析  

吴育鹏1 , 余乃通2 , 周启林2 , 王健华2 , 刘志昕2
1文昌市农产品质量安全检验检测站, 文昌, 571300; 2中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室, 海口, 571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 432 篇   
收稿日期: 2016年06月06日    接受日期: 2016年07月19日
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摘 要

201512月,为了分析采自海南海口城西仙人掌catK基因的序列及同源关系,利用RNA plant试剂盒提取仙人掌叶总RNA,反转录成第一链cDNA。同时设计仙人掌成熟酶K基因(matK)1对保守引物,利用RT-PCR的方法扩增仙人掌成熟酶K基因,所得序列经blastn进行比对,发现与已报道的22个仙人掌catK基因核苷酸序列一致;利用blastnDistance tree of results构建系统进化树,结果显示海南仙人掌catK基因与其它报道的30个仙人掌catK基因同源性最高,同源性在99%以上,属于同一组,而与Opuntia basilaris (GenBank accession No. JF786750.1)同源性最低,为96.6%。本研究利用RT-PCR方法获得了仙人掌成熟酶K基因序列,同时构建的系统进化树确定了该仙人掌成熟酶K基因的同源关系。本结果将为海南仙人掌的进化研究提供科学线索。

关键词
仙人掌;matK基因;克隆;序列分析
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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