垂序商陆抗坏血酸过氧化物酶(APX1)基因克隆及表达分析  

赵启红 , 张皓 , 刘海珍 , 徐吉臣
北京林业大学, 林木育种国家工程实验室, 北京, 100083
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 199 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

本研究从垂序商陆中克隆了抗坏血酸过氧化物酶基因PaAPX,CDS(coding sequence)全长为753bp,可编码250个氨基酸,预测蛋白分子质量为27.54kD,等电点为5.39,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成。生物信息学分析显示,在氨基酸水平上PaAPX1蛋白与菠菜的同源性达到93.2 %,系统进化树显示与菠菜、盐地碱蓬、甜菜等物种的亲缘性较近;实时荧光定量PCR结果显示,PaAPX1在块根、须根、茎、叶中均有表达,茎和叶中的表达量高于根;镉胁迫处理后,PaAPX1在块根、须根中上调表达,茎和叶中下调表达,且根中的表达量高于茎和叶。

关键词
垂序商陆;抗坏血酸过氧化物酶;基因克隆;表达分析
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基因组学与应用生物学
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