覃兆鲜 , 农素群 , 马青艳 , 刘明君 , 梁旦 , 王崇洲 , 潘天彪 , 谢炳坤

广西壮族自治区畜牧研究所广西家畜遗传改良重点实验室, 南宁, 530001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 79 篇   
收稿日期: 2015年12月01日    接受日期: 2016年01月01日

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本试验旨在对陆川猪FAM134B基因进行克隆及生物信息学分析。本研究利用GenBank公布的猪序列设计引物，应用RT-PCR扩增得到目的基因片段，应用生物信息学方法分析和预测了陆川猪FAM134B基因的理化性质与二级结构。结果显示：陆川猪FAM134B基因编码区全长1 107 bp，编码368个氨基酸；陆川猪FAM134B基因与与金华猪(JX854456.1)、牛(KM587693.1)、山羊(KF684947.1)、人(NM_001034850.2)、小鼠(NM_001034851.2)、大鼠(NM_001034912.1)、非洲爪蟾(NM_001126975.1)序列相似性分别为87.80%、87.44%、86.9%、68.47%、67.01%、67.29%、61.44%，结合系统进化树分析，结果表明不同物种FAM134B基因在进化过程中具有高度保守性。通过比较分析发现，陆川猪FAM134B基因CDS序列区比NCBI公布的金华猪FAM134B序列(JX854456.1)多了一段129 bp序列，比预测的猪FAM134B序列(XM_003483804.2)少了一段371 bp，这提示所扩增得到的陆川猪FAM134B基因有可能是另外一种剪接体。本研究成功克隆陆川猪FAM134B基因完整的CDS序列，为今后FAM134B基因在陆川猪的脂肪沉积及脂肪代谢方面的研究提供基础理论。

陆川猪；FAM134B；基因克隆