西瓜APX基因的序列分析及其茉莉酸甲酯诱导表达特性  

龙娅丽1 , 朱白婢2 , 徐子健1 , 张文2 , 江雪飞1
1热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室(海南大学)/海南大学园艺园林学院, 海口, 570228; 2海南省农业科学院蔬菜研究所/海南省蔬菜生物学重点实验室, 海口, 571100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 307 篇   
收稿日期: 2016年03月15日    接受日期: 2016年04月19日
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摘 要

摘 要 抗坏血酸过氧化物酶 (Ascorbate peroxidase, APX) 作为植物抗氧化防御系统中的重要一员,在一定程度上决定着植物的抗逆性。茉莉酸甲酯 (methyl jasmonate, MeJA) 作为逆境信号物质可以诱导植物抗逆响应,但是能否诱导APX基因表达、其表达趋势如何到目前为止尚未见报道。我们根据拟南芥APX同源基因AtAPXIII (AJ006030.1) 的序列在西瓜基因组数据库中搜索获得一个高度同源序列:Cla015833,命名为ClAPX1。我们对该基因进行了生物信息学分析并以二倍体西瓜细胞为材料,利用qRT-PCR技术对ClAPX1在茉莉酸甲酯诱导下的表达特性进行了研究。结果表明ClAPX1基因的转录起始位点位于起始密码子上游980 bp处,启动子区域包含典型启动子必须的调控元件,多个激素响应元件和逆境胁迫响应元件等;该基因编码的蛋白含有286个氨基酸,分子量为31.56 KD,理论等电点为6.67,此蛋白可能定位在细胞质中,属于cAPX;该基因在亲缘关系上较为接近同科的黄瓜和甜瓜。在茉莉酸甲酯施加了0.5 h后ClAPX1基因的表达量高于本底水平,一直持续到8 h,变化呈现出先上升后下降的趋势。本研究说明了ClAPX1基因对茉莉酸甲酯模拟的逆境信号做出了响应且表达量提高。本研究为利用茉莉酸甲酯提高植物抗逆性提供了理论支持,为植物的APX基因对茉莉酸信号响应方式和表达调控趋势做了补充,为以后深入研究APX基因奠定基础。

关键词
西瓜; APX基因; 茉莉酸甲酯; 表达特性
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基因组学与应用生物学
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