谷子、大麦、高粱抗黄矮病候选基因的生物信息学比较分析  

程金金1 , 刘红云1 , 范会1 , 程思远2 , 张书敏1 , 陈宇龙3 , 刘征1,3
1河北大学生命科学学院, 保定, 071002; 2湖南大学生物学院, 长沙, 410082; 3河北松塔坡农业开发有限公司, 保定, 073100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 242 篇   
收稿日期: 2016年02月09日    接受日期: 2016年02月29日
© 2016 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

黄矮病是禾本类作物的主要病害之一,该病主要由大麦黄矮病毒侵染所致,侵染该病毒后植株生理活动紊乱,叶片黄化至红化,结实率低,严重影响农作物的产量。大麦黄矮病毒最早发现于大麦作物中,对大麦抗黄矮病的研究较早,但至今仍未克隆到大麦黄矮病抗病基因。利用病毒诱导基因沉默系统和转基因技术,TIRB基因被验证具有抗黄矮病功能,是小麦抗黄矮病的关键基因。我们通过用小麦TIRB基因序列,在谷子、高粱和大麦基因库进行BLAST比对,发掘了谷子、高粱和大麦抗黄矮病候选基因,并运用生物信息学软件,分析、比较了这些基因所表达蛋白的理化性质,蛋白的亲疏水性及亚细胞定位,信号肽预测及三级结构等。不同物种中的这些基因具有相似的理化性质、亲疏水性、空间结构和功能结构域暗示着它们可能执行相近的抗病机制。总之,三种候选基因的发现,对于通过生物信息手段发掘作物抗病基因具有一定的指导意义。

关键词
谷子;大麦;高粱;黄矮病;抗病基因;生物信息学
本文全文 PDF 和全文 HTML 正在制作中
基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
阅览选项
. 全文 PDF
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
程金金
.
刘红云
.
范会
.
程思远
.
张书敏
.
陈宇龙
.
刘征
相关论文
.
谷子
.
大麦
.
高粱
.
黄矮病
.
抗病基因
.
生物信息学
服务
. 发表评论