张润敏 , 刘海宁 , 姚慧鹏 , 王晓丽 , 李成磊

四川农业大学生命科学学院, 雅安, 625014
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 521 篇   
收稿日期: 2016年07月18日    接受日期: 2016年08月21日

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基于苦荞转录组数据，采用RT-PCR技术克隆到1条苦荞过敏原蛋白基因的cDNA序列TBW17，并采用生物信息学方法对其编码蛋白进行了结构分析和抗原表位分析。结果表明，TBW17含有1个480 bp的开放阅读框，编码159个氨基酸，其氨基酸序列与多种植物过敏原蛋白同源性达52.20%~97.48%，蛋白家族分类显示其归为过敏蛋白中常见的Bet v1家族。抗原表位预测分析表明，该编码蛋白的T细胞表位位于91~99位，而B细胞表位位于第9~17、45~53和59~66位。以上结果为进一步对苦荞过敏原蛋白的检测和致敏机制研究提供了一定的理论基础。

苦荞；过敏蛋白；基因克隆；抗原表位分析