王炎炎 , 孙一丁 , 马继琼 , 杨奕 , 许明辉

云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所, 云南省农业生物技术重点实验室, 农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室, 昆明, 650223
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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 518 篇   
收稿日期: 2016年07月18日    接受日期: 2016年08月22日

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本研究利用特异引物对来源于云南的22份栽培稻及分别来源于海南、云南元江、江西东乡的3份普通野生稻(O. rufipogon Griff.)和1份长雄野生稻(O. longistaminata) Wx基因中第1内含子和第1内含子上游微卫星序列(CT)n的序列进行PCR扩增并测序。结果显示所有材料均能扩增出产物并获得碱基测序(包括长雄野生稻)，4份野生稻的(CT)重复次数分别是(CT)8、(CT)10、(CT)10、(CT)11，较栽培稻少；第1内含子中+1位碱基均为G。相较于栽培稻，野生稻在第1内含子与(CT)n重复中有明显区别于栽培稻的SNP位点，包含基因突变的InDel、转换和颠换3种类型。说明野生稻和栽培稻在进化的过程中出现了差异。Wx基因中微卫星序列(CT)n和第1内含子的序列可作为检测野生稻遗传组分的一个遗传标签。

野生稻；Wx基因；SNP