人APEX1基因的生物信息学分析  

郭润民1 , 黄金智2 , 卫月2 , 马天仲3
1广东医学院附属医院心血管内科, 湛江, 524001; 2广东医学院附属医院妇产科, 湛江, 524001; 3广东医学院附属医院生殖医学中心, 湛江, 524001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 317 篇   
收稿日期: 2016年03月14日    接受日期: 2016年04月13日
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摘 要

APEX1是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEX1基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEX1基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEX1基因序列及编码蛋白序列为研究对象,对人APEX1基因进行了系统进化分析及预测启动子及CpG 岛,并对其蛋白质理化性质及结构功能等进行了预测分析。核酸分析结果表明,人APEX1基因包含5个外显子,预测核心启动子区域为158~208 bp。进化分析结果显示,人与黑猩猩的遗传距离为0.003,亲缘关系最近。蛋白预测软件结果显示,人APEX1蛋白主要由自由卷曲及α-螺旋结构组成,无合适信号肽及明显跨膜区,表明该基因不参与跨膜物质运输及信号转导。

关键词
人;APEX1基因;生物信息学分析
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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