贵州杜仲栽培群体遗传多样性及亲缘关系的SSR分析  

林开勤1 , 李岩1,2 , 邹冰杰1 , 张天缘1 , 何选泽1 , 赵德刚1,2
1贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院, 山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025; 2贵州省山地生态与农业生物工程2011协同创新中心, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 220 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

杜仲为第三纪孑遗树种,是我国特有的国家二级重点保护植物。贵州是杜仲的主产区之一,其多个地区均有栽培,然而对其遗传背景尚不了解。本研究应用15个SSRs标记分析了贵州杜仲栽培群体的遗传多样性及亲缘关系,12个群体295个体共检测到76个等位基因,每个位点的等位基因数为3~10,其均值为5.067;每个群体的等位基因数na、期望杂合度He、Shannon指数I的平均值分别为4.011、0.533和0.996,多态位点百分率PPL除LL群体和QNY群体为93.3%外,其余10个群体的PPL都为100%,说明贵州杜仲群体具有较高的遗传多样性;湄潭群体MT和龙里群体LL的固定指数(F)平均值为负值,其余都为正值,表明群体内的杂合子缺失,群体内存在近亲繁殖现象;群体间的遗传分化系数FST为0.0660,遗传变异主要分布在群体内;UPGMA聚类分析发现,聚类分组并未按地区位置而聚类,这可能是在栽培过程中人为选择的结果,QNY群体与其他11个群体的遗传距离最大,XY群体和RH群体的遗传距离最近。本研究应用SSR分子标记探明其遗传多样性与亲缘关系,为杜仲的合理保护、种质资源收集提供建议。

关键词
杜仲;SSR分子标记;遗传多样性;亲缘关系
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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