张晓芬 , 冶贵生 , 马玉花 , 贺晓龙 , 康明 , 韩志辉 , 贾跃宁 , 张洪波

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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 403 篇   
收稿日期: 2016年05月11日    接受日期: 2016年06月11日

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为了研究藏羊GM-CSF基因及其编码蛋白的功能，提取藏羊脾脏总RNA，应用RT-PCR技术对藏羊GM-CSF基因进行扩增及测序，并利用DNA Star软件进行序列分析及编码蛋白结构预测。结果表明，藏羊GM-CSF基因长度为381bp，编码127个氨基酸。藏羊GM-CSF基因与参考绵羊、藏羚羊、山羊和水牛的GM-CSF基因的核苷酸序列同源性依次为100%、99.2%、98.7% 和92.1%，氨基酸序列同源性依次为100%、97.6%、96.9% 和81.0%。蛋白结构预测结果表明GM-CSF蛋白具有1个N-糖基化位点、1个N-豆蔻酰化位点、1个粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子信号、2个蛋白激酶C磷酸化位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。综合二、三级结构预测结果得出，该蛋白主要由α螺旋组成，其次是β转角和无规则卷曲，而b折叠相对较少。研究结果可为青海藏羊GM-CSF基因抗病功能的研究提供参考。

藏羊；GM-CSF基因；RT-PCR；序列分析；蛋白结构预测