莫之婧 , 马义丽 , 李康智

桂林医1学院, 生物化学与分子生物学教研室, 桂林, 541100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 450 篇   
收稿日期: 2016年06月28日    接受日期: 2016年07月26日

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查找与2型糖尿病相关的潜在基因及其参与的生物过程、信号通路和蛋白互作网络。利用GEO数据库中GSE20966数据集，采用GENE-E平台，筛选出与LPAR3共表达的基因，结合生物信息学工具GOC、DAVID、COREMINE、GeneMania对共表达基因进行基因功能富集分析、文本挖掘及蛋白互作分析。我们筛选出LPAR3在2型糖尿病患者胰腺β细胞中表达值显著低于正常对照组，其共表达基因603个，主要涉及代谢过程、信号调控等生物过程和Hippo信号通路。共表达相关系数高的8个基因与2型糖尿病相关，且均与肿瘤相关，涉及代谢过程、信号转导、发病机理、细胞增殖、细胞粘附等生物过程。LPAR3与20个已报道的2型糖尿病基因存在互作关系。本研究发现 LPAR3及其共表达基因可能与2型糖尿病相关，并可能增加患者罹患各系统肿瘤的风险。

LPAR3；2型糖尿病；生物信息学；数据库