贵州黑山羊和黔北麻羊LEPR基因第7、8、10和18外显子的多态性分析  

封竣淇 , 徐伟 , 康建兵 , 钱成 , 黄兰 , 罗卫星 , 蔡惠芬
贵州大学动物科学学院, 贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 502 篇   
收稿日期: 2016年07月19日    接受日期: 2016年08月24日
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摘 要

为探究LEPR基因的遗传多态性,丰富山羊LEPR基因的研究。本研究以贵州黑山羊,黔北麻羊为试验材料,运用DNA池结合直接测序方法的进行LEPR基因SNPs位点的筛选,从而对突变的SNPs位点进行RNA二级结构以及所编码蛋白质的二级结构,三级结构进行生物信息学分析。在试羊LEPR基因中共发现4个SNPs,分别为Exon7-T81C (同义突变)、Exon8-C39T (同义突变)、Exon10-A70G (Asn-Ser)和Exon18- C94T (Ser-Leu)。分析表明,4个位点突变前后的等位基因频率、mRNA二级结构的最小自由能、LEPR蛋白质二级结构和三级结构均有改变。结果表明,LEPR基因拥有较为丰富的遗传多态性。

关键词
LEPR;SNPs;贵州黑山羊; 黔北麻羊;生物信息学
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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