上饶早梨道地性农家种遗传多样性与亲缘关系的荧光AFLP分子标记分析  

尹明华1 , 周宇瑶2 , 苏爱芳1 , 曾日香1 , 钟宗林1 , 糜俊1 , 夏华炎1 , 洪森荣1
1上饶师范学院生命科学学院, 上饶, 334001; 2 北京中医药大学人文学院, 北京, 100029
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 452 篇   
收稿日期: 2016年06月26日    接受日期: 2016年07月19日
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摘 要

为了探讨上饶县花厅镇和田墩镇这两个相邻乡镇上饶早梨道地性农家种的遗传多样性与亲缘关系,采用6对EcoR I/ Mse I引物组合对其20个样本进行荧光AFLP分子标记分析。结果表明,上饶早梨2个道地性农家种20个样本6对引物组合扩增的平均位点数为84.83,平均多态性位点数为23.83,平均多态性百分率为28.09%。上饶早梨2个道地性农家种20个样本6对引物组合扩增位点的平均观测等位基因数Na为1.280 9,平均有效等位基因数Ne为1.207 6,平均Nie’s基因多样度H为0.114 9,平均香农信息指数I为0.166 1,遗传多样性水平较低。上饶早梨2个道地性农家种20个样品的遗传相似系数为0.748 5~1.000 0,平均值为0.890 6,个体间相似度较高。通过UPGMA聚类分析,上饶早梨2个道地性农家种20个样本被分为两大类。第Ⅰ类包括 “花厅六月雪”和“花厅黄皮消”,第Ⅱ类包括“田墩六月雪”,表明上饶县花厅镇和田墩镇这两个相邻乡镇上饶早梨的道地性农家种(“六月雪”)虽然具有相似的遗传物质基础,但也存在明显的种植地差异。根据6对EcoR I/ Mse I引物组合扩增位点的特异性,并依据其扩增模式图进行编码组合,构建了上饶早梨2个道地性农家种20个样本的DNA分子指纹图谱,可以用于上饶早梨各种植地农家种分子水平上的鉴定。

关键词
上饶早梨;道地性农家种;遗传多样性;亲缘关系;荧光AFLP分子标记
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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