高坡猪PRKAA1基因多态性检测及生物信息学分析  

张蓉1 , 李辉1 , 赵忠海1 , 施晓丽1 , 易恒洁1,2 , 石璇1 , 王成栋1,3
1贵州大学动物科学学院, 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵阳, 550025; 2贵州省遵义市正安县畜牧产业发展办公室, 遵义, 563400; 3贵州省毕节市农业产业办公室, 毕节, 551700
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 507 篇   
收稿日期: 2016年07月18日    接受日期: 2016年08月23日
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摘 要

为了对PRKAA1基因的遗传机理进行更进一步的研究,本试验以高坡猪为研究对象,利用PCR技术对PRKAA1基因的全部外显子进行克隆扩增,并对扩增产物进行正反向直接测序,运用生物信息软件进行序列分析;结果表明,仅在第七外显子75 bp处发现了A/G 1个单核苷酸突变位点,且该位点突变导致氨基酸密码子由CAA变为CAG,所对应编码的氨基酸也由谷酰胺酸(Gln)变为精氨酸(Arg),由于氨基酸的改变导致了PRKAA1基因的mRNA二级结构和蛋白质三级结构发生了构象改变。突变前后该蛋白分子量分别为136.152 kD和136.166 kD,PRKAA1蛋白无跨膜结构,不属于分泌蛋白。本研究结果可为高坡猪的PRKAA1基因表达载体的构建提供依据。

关键词
PRKAA1基因;多态性;生物信息学;高坡猪
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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