研究报告/Research Report

山羊KRTAP26-1基因鉴定及其遗传特征研究  

车陇杰1 , 王继卿1 , Huitong Zhou1,2 , 李涛1 , 赵孟丽1 , 胡江1 , 刘秀1 , 李少斌1 , 罗玉柱1*
1甘肃农业大学动物科学技术学院, 甘肃省草食动物生物技术重点实验室, 国际毛绒研究所, 甘肃, 730070;
2林肯大学农业与生命科学学院, 新西兰林肯, 7647
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2018 年, 第 37卷, 第 36 篇   
收稿日期: 2016年12月02日    接受日期: 2017年03月03日    发表日期: 2018年04月11日
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摘 要

摘要:角蛋白关联蛋白(keratin-associated proteins, KAPs)是羊毛和羊绒的主要结构成分,决定了它们的理化性质。在人类、家犬、小鼠和大鼠中已描述了高硫蛋白KAP26-1的编码基因,但在山羊中该基因尚未被鉴定。本研究以人类KRTAP26-1基因编码区序列为模板,利用BLAST软件,在山羊基因组中发现了与人类KRTAP26-1基因具有高度同源性的序列并被假定为山羊的KRTAP26-1基因。PCR-SSCP分析发现,在5个山羊群体的605个个体中有4条不同的核苷酸变异序列(定义为A~D)。序列同源性和进化树研究结果表明,这4条序列与已鉴定的其它山羊KRTAPs基因序列有较低的同源性,但与人类、家犬、小鼠和大鼠的KRTAP26-1基因序列具有最高的同源性。这说明发现的这4条序列是山羊KRTAP26-1基因的等位基因。4个等位基因的编码区内,共发现了6个SNPs位点,其中3个是非同义突变,造成了氨基酸序列的变化。4条多肽链含有36~38个磷酸化位点。5个山羊群体均处于中度多态,但是等位基因频率分布在不同群体间有差异。等位基因A、B和D在5个山羊群体中均出现,但C在中卫山羊中没有出现。结果表明,山羊KRTAP26-1基因有较为丰富的核苷酸序列变异,这些变异可能与绒山羊的产绒性能有关。

关键词
KRTAP26-1;核苷酸序列变异;遗传特征;PCR-SSCR;山羊;产绒性能
基因组学与应用生物学
• 第 37 卷
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