RT-PCR克隆籼稻叶绿素a/b结合蛋白基因全长cDNA及序列的in silico分析  

袁定阳1,2,4 , 余东1,2 , 谭炎宁1,2,3 , 孙志忠1,2 , 韶也1,2 , 孙学武1,2,4 , 段美娟1,2,4
1 湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室,湖南,长沙,410125;
2 湖南省农业科学院,湖南,长沙,410125;
3 湖南农业大学农学院,湖南,长沙,410126;
4 中南大学研究生院隆平分院,湖南,长沙,410125
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2012 年, 第 31卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2012年03月23日    接受日期: 2012年04月06日
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摘 要

根据日本晴cab4基因序列(GenBank:AK104499.1)设计引物,用RT-PCR的方法从籼稻9311中克隆了叶绿素a/b结合蛋白基因的全长cDNA,命名为cab-9311(cab gene from 9311)。in silico分析表明:cab-9311与cab4基因同源性为99%,编码的蛋白含有244个氨基酸,与cab4基因编码的蛋白同源性为98%。蛋白分子质量为26.9kDa,理论等电点为6.52。第54~216位氨基酸是一个典型的叶绿素a/b结合蛋白功能域(chlorophyll a/b binding domain)。跨膜分析和蛋白质三级预测显示,该蛋白在C端有一个典型的跨膜区。亚细胞定位分析表明该蛋白定位于叶绿体,是一个叶绿体内囊体膜上的锚定蛋白。

关键词
水稻;AtNPR1基因;转基因;水稻白叶枯病抗性;农艺性状表现
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基因组学与应用生物学
• 第 31 卷
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