陈晓汉 , 曾地刚 , 陈秀荔 , 谢达祥 , 赵永贞 , 杨春玲 , 马宁 , 李咏梅

广西壮族自治区水产研究所, 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室, 南宁, 530021
作者    通讯作者
水生生物研究, 2013 年, 第 2卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2013年09月17日    接受日期: 2013年10月05日    发表日期: 2013年10月25日

本文首次以英文发表在 《基因组学与应用生物学》(2013年第32卷第3期308-313页)上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License 协议对其进行授权，用中文再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。如果读者对中文含义理解有歧义，请以英文原文为准。

推荐引用：

引用格式(中文):

曾地刚, 基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析, 基因组学与应用生物学, 32(3): 303-318(10.3969/gab.032.000308)

引用格式(英文):

Zeng et al.,2013, Deep Sequencing-based Transcriptome Analysis of Litopenaeus Vannamei, Genomics and Applied Biology (Online) , 32(3): 303-318(10.3969/gab.032.000308)

凡纳滨对虾是世界养殖最广泛的甲壳动物，但是目前凡纳滨对虾的基因组及转录组数据还比较缺乏。为了获得凡纳滨对虾的转录组信息，本研究应用454高通量测序技术对凡纳滨对虾肝胰腺的转录组进行测序。获得了500 177条凡纳滨对虾EST，平均长度363 bp。拼接获得了20 225 条unigene，长度范围50~8 980 bp，平均长度507 bp。所有unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库(Nr)进行相似搜索(E 值<10-5)，结果一共有13 676条unigene (68%)与数据库中的已知基因同源。此外，还对unigene进行了GO、COG和KEGG的功能注释、分类或通路分析。我们通过高通量测序，获得了丰富的凡纳滨对虾转录组信息，为凡纳滨对虾的新基因克隆和基因组学研究提供了有价值的数据。

高通量测序；凡纳滨对虾；转录组