研究报告/Research Report

白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析  

马成通1,2 , 钱洁颖1,2 , 刘镛3 , 陶晨陈1,2 , 苏荷玲2,4 , 晁耐霞1,2 , 吴耀生1,2
1广西医科大学生物化学与分子生物学教研室, 南宁, 530021;
2广西高校生物分子医学研究重点实验室, 南宁, 530021;
3广东医学院药学院, 东莞, 523808;
4桂林医学院, 桂林, 541004
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2016 年, 第 5卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2016年02月10日    接受日期: 2016年02月10日    发表日期: 2016年02月10日
© 2016 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》(2016年第35卷第1期183-189页)上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:

引用格式(中文):

马成通, 钱洁颖, 刘镛, 陶晨陈, 苏荷玲,  晁耐霞, 吴耀生, 2016, 白皮黄瓜鲨烯合酶基因cDNA克隆及生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 35(1): 183-189 (doi: 10.13417/j.gab.035.000183)

引用格式(英文):

Ma C.T., Qian J.Y., Liu Y., Tao C.C., Su H.L., Chao N.X., and Wu Y.S., 2016, Cloning and Bioinformatic Analysis of Squalene Synthase Gene from White Cucumber, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 35(1): 183-189 (doi: 10.13417/j.gab.035.000183)

摘 要

为认识葫芦科植物中葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因结构特征,克隆白皮黄瓜鲨烯合酶(squalene synthase, SS)基因cDNA并进行生物信息学分析。根据葫芦科植物绞股蓝、罗汉果、红花栝楼等的鲨烯合酶基因cDNA序列,设计白皮黄瓜鲨烯合酶引物,分别采用3'RACE和5'RACE技术扩增鲨烯合酶基因3'端和5'端。获得白皮黄瓜鲨烯合酶基因的两个cDNA克隆,命名为CsSS1和CsSS2,其cDNA序列全长分别为1 627 bp和1 534 bp,都编码417个氨基酸残基,分子质量为47.6 kD。成功克隆得到白皮黄瓜鲨烯合酶基因全长cDNA序列并对其进行序列分析,后续可用于葫芦素生物合成途径所需鲨烯合酶基因正选择位点功能分析。

关键词
白皮黄瓜;鲨烯合酶;RACE;基因克隆;生物信息学分析
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计算分子生物学
• 第 5 卷
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