高源隆^1,2 , 董旋^1,3 , 赵德刚^1,2,3

1贵州大学生命科学学院山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025
2贵州大学农业生物工程研究院贵州省农业生物工程重点实验室, 贵阳, 550025
3贵州大学绿色农药与农业生物工程国家重点实验室培育基地, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
计算分子生物学, 2014 年, 第 3卷, 第 4 篇   
收稿日期: 2014年09月08日    接受日期: 2014年09月22日    发表日期: 2014年10月08日

本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》(2014年第33卷第4期836-844页)上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。

推荐引用：

引用格式(中文)：

高源隆, 董旋, 赵德刚, 2014, 杜仲 EuFLC1 基因克隆与生物信息学分析, 基因组学与应用生物学, 33(4): 836-844 (doi: 10.13417/j.gab.033.000836)

引用格式(英文)：

Gao Y.L., Dong X., and Zhao D.G., 2014, Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Gene EuFLC1 in Eucommia ulmoides Olive, Jiyinzuxue Yu Yingyong Shengwuxue (Genomics and Applied Biology), 33(4): 836-844 (doi: 10.13417/j.gab.033.000836)

以杜仲(Eucommia ulmoides Olive)雄花花芽为材料，依靠实验室构建的杜仲转录组库，采用cDNA末端快速扩增法克隆了3'端包含完整开放阅读框的745 bp cDNA序列。经3'RACE产物和转录组库中5'端序列拼接，获得全长为872 bp的杜仲FLC的cDNA序列，编码86个氨基酸，命名为EuFLC1。生物信息学分析显示：EuFLC1 蛋白分子量约为10.005 kD，理论等电点为10.47，为亲水性蛋白；存在3个可能的磷酸化位点、1个可能的核定位信号和1个可能的核输出信号；不存在跨膜螺旋和信号肽；蛋白二级结构中包含2个α螺旋和4个β折叠，无规卷曲连接α螺旋及β折叠；蛋白三级结构同源建模结果表明，EuFLC1蛋白包含2个互相垂直的α螺旋，α螺旋间有2个处于同一平面的β折叠，蛋白的N端和C端为无规卷曲并伸向整 体结构的一侧；是含有MEF2_like型 MADS-box 结构域的MADS-Box基因。Blastp结果中，与EuFLC1同源性较高的序列有：葡萄的flowering locus C、小粒种咖啡的MADS-box protein FLC subfamily、巨峰葡萄的flowering locus C-like MADS-box protein，因此认为EuFLC1是杜仲FLC基因。系统发育树表明杜仲与同属唇形类植物的小粒咖啡聚为一支，与 APG Ⅲ分类系统的分类结果一致。该基因为首次从第三纪孑遗植物杜仲中克隆到的MADS-Box基因，为研究MADS-Box基因的演化的提供了一个重要材料，为研究杜仲开花时间的分子调控机制奠定了基础。

杜仲；EuFLC1；克隆；生物信息学分析