马氏珠母贝组蛋白 H3 基因的克隆与表达特性分析  

潘晓艳 , 郑哲 , 田荣荣 , 焦钰 , 杜晓东
广东海洋大学水产学院, 湛江, 524025
作者    通讯作者
海洋生物学学报, 2015 年, 第 4 卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2015年06月01日    接受日期: 2015年06月30日    发表日期: 2015年12月23日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》第34卷上。现依据版权所有人授权的许可协议,采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权,再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用:
引用格式(中文):
杜晓东等, 2015, 马氏珠母贝组蛋白 H3 基因的克隆与表达特性分析, 基因组学与应用生物学(online) Vol.4 No.34 (doi: 10.5376/jmb.cn. 2015.04.0005)
引用格式(英文):
Du et al., 2015,The Influences of Simulated Typhoon to Two Kinds of Oxidative Stress GenesExpression of Pinctad amartensii, Jiyin Zuxue yu Yingyong Shengwuxue (online) (Genomics and Applied Biology) Vol.4No.34(doi: 10.5376/jmb.cn. 2015.04.0005)
摘要

组蛋白 H3 是组成核小体的基本组分之一。 研究表明,组蛋白不仅参与染色质的组装,也可以通过调节基因表达参与调控细胞分裂、凋亡、 DNA 修复等细胞生命过程。为了探究马氏珠母贝组蛋白 H3(Pinctada martensii histone H3, PmH3)的序列及表达特征,本文运用 cDNA 末端快速扩增(RACE)技术克隆得到 PmH3 的 cDNA 全长序列,并且应用实时荧光定量 PCR 技术对 PmH3 基因在马氏珠母贝不同组织中的表达进行检测。结果显示,PmH3 基因序列全长 627 bp,其中开放阅读框(ORF)为 411 bp,编码 136 个氨基酸,5' UTR 为 42 bp,3' UTR 为 174 bp,包含 26 bp 的 polyA。 预测其相对分子量为 15 388.0 Da,理论等电点为 11.27,不稳定系数为 47.19,疏水性水平 -0.604。多序列比对结果表明 H3 基因极为保守,在各物种间的相似度达到 99%~100%。SMART 软件分析发现 PmH3 具有一个典型的 H3 结构域。荧光定量 PCR 数据结果显示,PmH3 基因在马氏珠母贝外套膜边缘区、 外套膜中央区、 鳃、 血细胞、 闭壳肌、 足、 性腺、 肝胰腺八种组织中均有表达,其中在性腺中表达量最高。本研究可为进一步探讨 PmH3 基因在贝类中的生物学特性以及组蛋白修饰提供理论依据。

 

关键词
马氏珠母贝;组蛋白H3;基因克隆;荧光定量PCR;组蛋白修饰

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海洋生物学学报
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