基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析 
曾地刚 
,
陈秀荔 ,
谢达祥 ,
赵永贞 ,
杨春玲 ,
马宁 ,
李咏梅 ,
陈晓汉 
,
陈秀荔 ,
谢达祥 ,
赵永贞 ,
杨春玲 ,
马宁 ,
李咏梅 ,
陈晓汉
广西壮族自治区水产研究所, 广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室, 南宁, 530021
作者 通讯作者
海洋生物学学报, 2013 年, 第 2卷, 第 5 篇
收稿日期: 2013年01月15日 接受日期: 2013年02月13日 发表日期: 2013年04月15日
作者 通讯作者
海洋生物学学报, 2013 年, 第 2卷, 第 5 篇
收稿日期: 2013年01月15日 接受日期: 2013年02月13日 发表日期: 2013年04月15日
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本文首次发表在 《基因组学与应用生物学》2012年第32卷上。现依据版权所有人授权的许可协议，采用 Creative Commons Attribution License,协议对其进行授权，再次发表与传播。只要对原作有恰当的引用, 版权所有人允许并同意第三方无条件的使用与传播。
推荐引用：
引用格式(中文)：
曾地刚等, 2013, 基于高通量测序的凡纳滨对虾的转录组分析, 基因组学与应用生物学(online) Vol.1 No.32 (doi: 10.5376/jmb.cn. 2013.01.0005)
引用格式(英文)：
Zeng et al., 2013, Deep Sequencing-based Transcriptome Analysis of Litopenaeus vannamei, Jiyin Zuxue yu Yingyong Shengwuxue (online) (Genomics and Applied Biology) Vol.1 No.32(doi: 10.5376/jmb.cn. 2013.01.0005)
摘 要
本研究应用454高通量测序技术对凡纳滨对虾肝胰腺的转录组进行测序。获得了500 177条凡纳滨对虾EST，平均长度363 bp。拼接获得了20 225条unigene，长度范围50 bp - 8 980 bp，平均长度507 bp。所有unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库（Nr）进行相似搜索（E值<10-5），结果一共有13676条unigene（68%）与数据库中的已知基因同源。此外，还对unigene进行了GO、COG和KEGG的功能注释、分类或通路分析。我们通过高通量测序，获得了丰富的凡纳滨对虾转录组信息，为凡纳滨对虾的新基因克隆和基因组学研究提供了有价值的数据。
关键词
高通量测序；凡纳滨对虾； 转录组
